Berikut ini adalah daftar nama-nama pelabuhan di seluruh Indonesia. Jeni pelabuhan berdasarkan pelayanannya adalah sebagai berikut :
- Pelabuhan Internasional Hub, utama primer yang melayani nasional dan internasional dalan
jumlah besar. dan merupakan simpul dalam jaringan laut internasional. - Pelabuhan International, utama sekunder yang melayani nasional maupun internasional dalam
jumlah besar yang juga menjadi simpul jaringan transportasi laut internasional. - Pelabuhan Nasional, utama tersier yang melayani nasional dan internasional dalam
jumlah menengah. - Pelabuhan Nasional, utama tersier yang melayani nasional dan internasional dalam
jumlah menengah. - Pelabuhan Lokal, pelabuhan pengumpan sekunder yang melayani lokal dalam jumlah kecil.
Secara teknis pelabuhan adalah salah satu bagian dari Ilmu Bangunan Maritim, dimana padanya dimungkinkan kapal-kapal berlabuh atau bersandar dan kemudian dilakukan bongkar muat. Pelabuhan tanjung priok di Jakarta dan pelabuhan Tanjung Perak di Surabaya sangat terkenal. Di Indonesia terdapat beberapa pelabuhan yang berada di masing-masing pulau. Berikut ini adalah daftar nama pelabuhan di Indonesia :
Jawa
- Cirebon, Jawa Barat
- Tanjung Priok, Jakarta
- Ciwandan, Banten
- Cigading, Banten
- Merak, Banten
- Sunda Kelapa, Jakarta
- Tanjung Perak, Surabaya, Jawa Timur
- Tanjung Mas, Semarang, Jawa Tengah
- Tanjung Intan, Cilacap, Jawa Tengah
- Kalianget, Madura
Sumatera
- Belawan, Sumatera Utara
- Palembang, Sumatera Selatan
- Teluk Bayur, Sumatera Barat
- Jambi
- Bengkulu
- Panjang, Lampung
- Pangkal Balam, Bangka-Belitung
- Tanjung Pandan, Bangka-Belitung
- Sungai Pakning, Dumai, Riau
- Krueng Geukueh, Aceh
- Kijang, Bintan
Kalimantan
- Banjarmasin, Batu Licin, Satui, Kalimantan Selatan
- Pontianak, Kalimantan Barat
- Palangkaraya, Sampit-Kotim, Kumai-Kobar, Bagendang-Sampit, Kuala Pembuang-Seruyan, Kalimantan Tengah
- Semayang, Balikpapan
Sulawesi
- Makassar, Sulawesi Selatan
- Palopo, Sulawesi Selatan
- Belopa, Sulawesi Selatan
- Malili, Sulawesi Selatan
- Pare Pare, Sulawesi Selatan
- Kendari, Sulawesi tenggara
- Buton, Sulawesi Tenggara
- Bitung, Sulawesi Utara
- Palu, Sulawesi Tengah
- Polewali, Sulawesi Barat
- Barru , Sulawesi Selatan Bar
Bali dan Nusa Tenggara
- Benoa, Bali
- Lembar, Lombok
- Waingapu, Sumba
- Kupang, Timor Barat
- Kabupaten Belu, Kantor Pelabuhan Atapupu
- Kabupaten Timur Tengah Utara, Kantor Pelabuhan Wini
- Kabupaten Flores Timur, Larantuka
- Lorosay,kabupaten sikka,maumere
Maluku Utara
- Administrasi Pelabuhan Ternate
- Kantor Pelabuhan Buli
- Kantor Pelabuhan Daruba
- Kantor Pelabuhan Sanana
- Kantor Pelabuhan Tobelo
- Kantor Pelabuhan Labuha
- Kantor Pelabuhan Gebe
- Kantor Pelabuhan Jailolo
- Kantor Pelabuhan Soa Sio
- Kantor Pelabuhan Laiwui
Maluku
- Administrasi Pelabuhan Ambon
- Kantor Pelabuhan Tuhelu
- Kantor Pelabuhan Saumlaku
- Kantor Pelabuhan Wahai
- Kantor Pelabuhan Waisarisa
- Kantor Pelabuhan Namlea
- Kantor Pelabuhan Amahai
- Kantor Pelabuhan Geser
- Kantor Pelabuhan Leksula
- Kantor Pelabuhan Tual
Papua Barat
- Administrasi Pelabuhan Sorong
- Administrasi Pelabuhan Manokwari
- Administrasi Pelabuhan Fak-fak
- Kantor Pelabuhan Kaiman
- Kantor Pelabuhan Bintuni
- Kantor Pelabuhan Taminbuan
- Kantor Pelabuhan Wasior
